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펩타이드 (Peptide Synthesis)

Peptide Library Service

블루젠
2024.02.14 13:50 448 0

본문

Peptide Library Service

Overview

펩타이드 라이브러리는 Immunotherapy, Vaccine 연구, Proteomics 및 약물 개발을 위해 표적 스크리닝에 널리 사용되는 합성 서비스입니다. Crude 부터 98% 순도까지 96-well plate와 individual vial 형태로 제공이 가능하며, High-quality 펩타이드 합성을 위한 TFA removal, solubility test, Endotoxin service, 등 다양한 부가적인 서비스도 함께 제공 드립니다.


Standard Peptide Library Specifications

Crude Peptide LibraryPurified Peptide Library
Length5~25 aa5~25 aa
PurityCrude≥70% to ≥98%
Quantity1~20 mg≥1 mg
Minimum Order Size24 ea Peptides24 ea Peptides
Deliverable FormatLyophilized Peptides in 96-well Plate or Individual Well-labelled Vials
Quality DocumentsMS only or COA, HPLC and MS for each PeptideCOA, HPLC and MS for Each Ppeptide
ModificationsBiotin, Fluorescent Dyes, Phosphorylation, Methylation, Acylation, Acetylation, Unnatural Amino Acids, and Many More


Micro-scale Peptide Library Service

Micro-scale Peptide Library는 일반적인 Standard Peptide Library 서비스와 달리 1 mg 미만의 제작이 가능합니다. Preliminary Screening 실험 및 Proteomics에 적합한 서비스입니다.

Micro-scale Peptide Library
Length5~20 aa
PurityCrude70%
Quantity0.2~0.5 mg
Minimum Order Size24 ea Peptides
Deliverable FormatLyophilized or Liquid (Suspended in 0.05% Trifluoroacetic Acid (TFA) in 50% (v/v) Acetonitrile/Water) in Thermo Scientific Matrix 96-tube Plates
Quality DocumentsMS, HPLC and COA on 100% of Peptides
ModificationsAmidation, Acetylation, Biotin, FITC-Ahx, Isotope Labeling on K/R, Arg (13C6, 15N4), Lys (13C6, 15N2) and Others

* TFA removal, Modifications 서비스는 유료 서비스입니다


Application

- Monitoring protease activity

- Identifying protease substrates using FRET

Targeted proteomics

- Selected reaction monitoring

- Analysis of protein abundance in metabolic pathways

- Assessing protein subunit stoichiometry

- Identifying phosphorylation events in signaling pathways

- Evaluating biomarker expression from serum samples

Peptide Library 종류

Overlapping Library

Overlapping Peptide 라이브러리는 Linear 또는 연속적인 Epitope Mapping에 사용할 수 있습니다. 단백질 또는 펩타이드 내의 어떤 부분의 아미노산이 기능을 하는지, 스크리닝을 하는데 유용한 서비스입니다. 기본적으로 펩타이드의 길이와 Offset을 매개변수로 하여 동일한 길이의 수많은 펩타이드를 순차적으로 합성할 수 있습니다.


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Overlapping Library Applications

- Scan an antigen sequence for epitopes

- Screen a protein for a substrate

- Identify a T-cell epitope

- Stimulate T-cells in T-cell assays

- Map antibody epitopes

- Search for other binding sites within a given protein

Alanine Scanning Library

Alanine Scanning Library 는 펩타이드의 기능, 안정성 및 형태를 담당하는 특정 아미노산 잔기를 식별하도록 설계되었습니다. 가장 작은 kiral 아미노산인 Alanine은 각 비 Alanine 잔기에 대해 한 번에 하나씩 순차적으로 치환되며, 이에 따라 Epitope 활성의 변화를 측정할 수 있습니다. 아미노산 잔기를 Alanine으로 치환하면 Epitope 결합의 활성이 변경됩니다. 해당 라이브러리는 펩타이드에 대한 개별 아미노산의 기여도를 신속하게 분석할 수 있습니다.


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Alanine Scanning Library Applications

- Identify key residues in epitopes

- Evaluation function property of enzymes

- Study binding sites of proteins


Truncation Library

Truncation Library는 epitope 활성에 필요한 펩타이드의 최소 길이를 결정할 수 있으며, 라이브러리는 각각의 펩타이드 말단으로 부터 체계적인 절단을 통해 생성됩니다.

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Truncation Library Applications

- Identify the minimal length of the epitope

- Map the minimal binding site of a protein for core binding

Positional Scanning Library

Positional Scanning Library는 펩타이드 시퀀스의 최적화를 위한 중요한 도구로, 주어진 서열에서 아미노산 한 개씩 다른 아미노산으로 대체하여 펩타이드의 활성을 향상시키는 아미노산을 확인하기 위해 사용합니다. 이러한 라이브러리는 최소한의 합성과 스크리닝만으로 단백질 혼합물의 T-cell Epitope를 확인하는데 매우 유용합니다. Truncation Library는 epitope 활성에 필요한 펩타이드의 최소 길이를 결정할 수 있으며, 라이브러리는 각각의 펩타이드 말단으로 부터 체계적인 절단을 통해 생성됩니다.

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Positional Scanning Library

- Optimize peptide binding sites

- Increase activity of enzyme substrates

- Enhance antibody epitopes

- Improve T-cell epitopes

Random Library

Random Library는 시퀀스 최적화를 위한 방법으로 shotgun 접근법을 통해 기존의 아미노산 서열에서 무작위로 선택하여 약 20개의 천연 아미노산 서열로 대체됩니다. 이러한 Random Library는 선택된 아미노산 잔기 내에서 가능한 많은 서열 변이를 가공하여 활성이 높은 펩타이드 서열을 디자인 할 수 있습니다.


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Random Library Application

- Peptide sequence optimization

- Improve T-cell epitopes

- Enhance antibody epitopes

- Target identification Drug discovery

Scrambled Library

Scrambled Library는 주어진 펩타이드의 시퀀스의 교환과 치환을 통해 변경되며, 시퀀스 최적화를 위해 사용하거나 단백질, 항체 및 DNA에 포함된 타겟 분자를 조사하는데 사용할 수 있습니다.

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Scrambled Library

- Screening proteins of interest

- Negative controls

T-Cell Truncated Library

T-cell epitope는 세포 내 존재하는 MHC 수용체에 의해 인지되는 작은 펩타이드 시퀀스로 면역 시스템 활성을 극대화 시킬 수 있습니다. T-cell epitope는 MHC I 복합체에서 8~11 mer의 길이를 MHC II 복합체에서는 15~24 mer의 길이를 가지며, T-Cell Truncated Library는 이러한 길이의 펩타이드 풀이 순차적으로 구성되어 있습니다. T-Cell Truncated Library는 T-cell 수용체를 재설계하여 epitope를 보다 효율적으로 인식할 수 있습니다.

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T-Cell Truncated Library Application

- Allow to test all possible T-cell epitopes across a protein of interest